Setelah tanggal 1 September 2021 mengadakan program vaksinasi dosis 1 untuk pelajar, keluarga besar Yayasan Khadijah dan masyarakat umum, kini Yayasan Khadijah kembali menyelenggarakan vaksinasi dosis 2 pada hari Rabu, 6 Oktober 2021 di lapangan Basket SMP-SMA Khadijah. Stok vaksin yang disediakan sejumlah 1200 dosis. Kegiatan percepatan vaksinasi di kalangan pelajar ini didukung atas kerja sama Yayasan Khadijah Surabaya, Pemerintah Provinsi Jawa Timur dan Kementerian Kesehatan Republik Indonesia ( Rumah Sakit Husada Prima Surabaya).